 | Beetlejuice Beetlejuice (2024) als Lydia Deetz |
 | Haunted Mansion (2023) als Pat (uncredited) |
 | Meet Me in the Bathroom (2022) als Self |
 | Gone in the Night (2022) als Kath |
 | Winona Ryder - Die Geister, die sie rief (2022) als Self - Actress (archive footage) |
 | The Mojo Manifesto: The Life and Times of Mojo Nixon (2022) als Self |
 | Hannibal Hopkins et Sir Anthony (2021) als Self (archive footage) |
 | Sarah Cooper: Everything's Fine (2020) als Lacey Groin |
 | Destination Wedding (2018) als Lindsay |
 | Author: The JT LeRoy Story (2016) als Herself |
 | Experimenter (2015) als Alexandra "Sasha" Milgram |
 | Turks & Caicos (2014) als Melanie Fall |
 | Homefront (2013) als Sheryl Marie Mott |
 | Ben Lee: Catch My Disease (2012) als Self |
 | Frankenweenie (2012) als Elsa Van Helsing (voice) |
 | The Letter (2012) als Martine Jamison |
 | The Iceman (2012) als Deborah Kuklinski |
 | Stay Cool (2011) als Scarlet Smith |
 | Black Swan: Metamorphosis (2011) als Herself |
 | The Dilemma (2011) als Geneva Brannen |
 | Black Swan (2010) als Beth Macintyre / The Dying Swan |
 | When Love Is Not Enough: The Lois Wilson Story (2010) als Lois Wilson |
 | The Private Lives of Pippa Lee (2009) als Sandra Dulles |
 | Star Trek (2009) als Amanda Grayson |
 | The Informers (2008) als Cheryl Moore |
 | The Last Word (2008) als Charlotte Morris |
 | The Blood Is the Life: The Making of 'Bram Stoker's Dracula' (2007) als Self (archive footage) |
 | Welcome (2007) als Cynthia |
 | Voom Portraits (2007) als Self |
 | The Ten (2007) als Kelly La Fonda |
 | Sex and Death 101 (2007) als Death Nell / Gillian De Raisx (#101) |
 | Marc Jacobs & Louis Vuitton (2007) als Herself |
 | One Summer in Austin: The Story of Filming 'A Scanner Darkly' (2006) als Self / Donna |
 | A Scanner Darkly (2006) als Donna Hawthorne |
 | The Darwin Awards (2006) als Siri Taylor |
 | Nos Bastidores de Hollywood (2005) als Self |
 | The Heart Is Deceitful Above All Things (2004) als Psychologist |
| | Cabin Fever: Beneath the Skin (2004) als (archive footage) (uncredited) |
 | One Step Beyond: Making 'Alien: Resurrection' (2003) als Self |
 | Declaration of Independence (2003) als Self |
 | The Day My God Died (2003) als Narrator (voice) |
 | S1m0ne (2002) als Nicola Anders |
 | Mr. Deeds (2002) als Babe Bennett |
 | Zoolander (2001) als Winona Ryder (uncredited) |
 | Swatch Dogs and Diet Coke Heads (2001) als Self |
 | Lost Souls (2000) als Maya Larkin |
 | Autumn in New York (2000) als Charlotte Fielding |
 | Girl, Interrupted (1999) als Susanna Kaysen |
 | Celebrity (1998) als Nola |
 | Alien Resurrection (1997) als Annalee Call |
 | The Crucible (1996) als Abigail Williams |
 | Looking for Richard (1996) als Self / Lady Anne |
 | Boys (1996) als Patty Vare |
 | How to Make an American Quilt (1995) als Finn Dodd |
 | Little Women (1994) als Jo March |
 | Reality Bites (1994) als Lelaina Pierce |
 | The House of the Spirits (1993) als Blanca Trueba |
 | The Age of Innocence (1993) als May Welland |
 | Innocence and Experience: The Making of 'The Age of Innocence' (1993) als Self |
 | Making 'Bram Stoker's Dracula' (1992) als Self |
 | Bram Stoker's Dracula (1992) als Mina Murray / Elisabeta |
 | Blood Lines: Dracula - The Man. The Myth. The Movies. (1992) als Self |
 | Night on Earth (1991) als Corky |
 | The Making of Edward Scissorhands (1990) als Self |
 | Mermaids (1990) als Charlotte Flax |
 | Edward Scissorhands (1990) als Kim |
 | Welcome Home, Roxy Carmichael (1990) als Dinky Bossetti |
 | Great Balls of Fire! (1989) als Myra Gale Brown |
 | Heathers (1989) als Veronica Sawyer |
 | 1969 (1988) als Beth Carr |
 | Beetlejuice (1988) als Lydia Deetz |
 | Square Dance (1987) als Gemma |
 | Lucas (1986) als Rina |
| | Black Swan: Metamorphosis Thanks |
| | The Day My God Died Producer |
| | Girl, Interrupted Executive Producer |