| Helicopter (2024) als Himself |
| Tripping The Dark Fantastic (2022) als Himself |
| Les Méchants (2021) als Mysterious man |
| A Nau dos Loucos: Mergulho e Decolagem de Pazucus (2021) als Self |
| Psychomagie, un art pour guérir (2019) als Himself |
| Violeta más viva que nunca (2017) als Himself (archive footage) |
| Alejandro Jodorowsky and the Seagulls (2016) als Himself |
| Poesía sin fin (2016) als Old Alejandro |
| Alejandro Jodorowsky's Social Psychomagic (2014) als Himself |
| My Life Directed by Nicolas Winding Refn (2014) als Self |
| Jodorowsky's Dune (2013) als Self |
| La danza de la realidad (2013) als Old Alejandro |
| Ritual - Una storia psicomagica (2013) als Fernando |
| NWR (2012) als Self |
| The Island (2011) als Jodo |
| Forget Everything You Have Ever Seen: The World of Santa Sangre (2011) als Himself |
| La colorina (2008) als Self |
| Nacido Sin (2008) |
| Niente è come sembra (2007) |
| In Search of Moebius (2007) als Himself |
| Moebius Redux: A Life in Pictures (2007) als Self |
| A Conversation with Alejandro Jodorowsky (2007) |
| Arrabal, Panik Cineast (2007) als Self |
| Midnight Movies: From the Margin to the Mainstream (2006) als Himself |
| Musikanten (2006) als Ludwig van Beethoven |
| Pas si grave (2003) als Pablo |
| Alejandro Jodorowsky: Interview at ICA London December 2002 (2003) |
| Psicotaxi (2002) als Himself |
| Cherif (2002) als Prophet |
| Blink Jodorowsky (2002) als Himself |
| Les Contes de Jodo - Contes philosophiques (1997) als Alejandro |
| Jean Cocteau, mensonges et vérités (1997) als Self |
| La constellation Jodorowsky (1994) als Self |
| La montaña sagrada (1973) als The Alchemist |
| El Topo (1970) als El Topo |
| Fando y Lis (1970) als Puppeteer (uncredited) |
| Anticlimax (1969) |
| He! Viva Dada (1965) als Self |
| Teatro sin fin (1965) als Himself |
| La cravate (1957) |
| The Family Forest als Himself |
| Viaje esencial als Old Alejandro |