De democratische natie Patria werd opgericht op het continent Patria. Vanwege economische geschillen splitste het land zich op tussen het noorden en het zuiden, waardoor de Noordelijke Unie van Patria en de Zuidelijke Confederatie van Patria ontstonden, en ze voerden een lange burgeroorlog. Nu hun aantal afneemt, besluit het Noorden verboden technologie te gebruiken om het Zuiden te verslaan. Deze technologie verandert mensen in monsterachtige soldaten, waardoor ze bijna goddelijke krachten krijgen. En met die bevoegdheden kwam er een einde aan de lange oorlog en werd de vrede hersteld.
Het verhaal speelt zich af tussen de Kamakura- en Muromachi-periodes, tijdens de Kenmu-restauratie, en volgt het verhaal van Hojo Tokiyuki, een jongen die op de vlucht is nadat zijn familie is omvergeworpen door Ashikaga Takauji. Omdat zijn enige bondgenoten een duistere priester en zijn volgelingen zijn, moet de jonge heer wraak zoeken en zijn glorie herwinnen, met zijn enige wapen: een bovenmenselijk vermogen om te vluchten en zich te verstoppen.
In de door misdaad geteisterde, door de maffia bestuurde stad Ergastulum zijn Worick en Nicolas twee ‘klusjesmannen’, bekend als ‘Benriya’, die elk vuil klusje van de politie of de maffia overnemen – voor een goede prijs. Na een opdracht van de politie ontmoetten de twee elkaar en later vergezeld door Alex, een voormalige prostituee die geïnteresseerd raakte in de mysterieuze achtergrond van het team, in het bijzonder in de capaciteiten van Nicolas.
In het jaar 2063 worden acht middelbare scholieren en een kind naar Planet Camp gevlogen, waar ze een paar dagen op zichzelf moeten overleven. Maar kort na aankomst worden ze door een onheilspellende gloeiende bol naar een onbekend kwadrant van de ruimte gebracht, op bijna 5012 lichtjaar afstand. Nu is de enige weg terug naar huis een langzame, gevaarlijke tocht door het universum – een reis die hen op de proef zal stellen op manieren die Planet Camp nooit zou kunnen.
Een gewone wandeling van school naar huis verandert in een epische reis voor Usato. Nadat hij plotseling met twee medestudenten in een andere wereld is gedropt, ontdekt Usato dat hij daar per ongeluk is opgeroepen. Maar de zaken veranderen wanneer hij een unieke aanleg voor genezende magie ontdekt! Nu traint hij voorbij de menselijke beperkingen en gebruikt hij zijn zelfherstellende vermogens om absurde kracht en een ongeëvenaard uithoudingsvermogen te verwerven.
Twee moordenaars staan tegenover elkaar op een bepaalde 'werkplek'. De coole premiejager Chateau en de mysterieuze en krachtige Ryang-Ha. Chateau en Ryang-Ha worden vijanden na dit gevecht - dat hadden ze tenminste moeten doen, maar om de een of andere reden vindt Ryang-Ha Chateau leuk en begint haar te volgen. Beetje bij beetje ontwikkelt Chateau een samenwerkingsverband met Ryang-Ha, waardoor ze verwikkeld raakt in de strijd tegen de organisaties die op hem jagen. Bovendien houdt die strijd ook verband met haar verleden. Waarom benaderde Ryang-Ha Chateau? Wat is Chateau's geheime verleden?
De Engelse kroon is door de geschiedenis heen fel bevochten en in de middeleeuwen werd een reeks grote burgeroorlogen bekend als de Rozenoorlog. De hertog van York eiste het recht op de troon op en probeerde koning Hendrik VI en zijn troonopvolger van de troon te stoten om zelf koning te worden.
Rin Asōgi ziet er aan de buitenkant misschien uit als een gewone kantoordame, maar ze is eigenlijk een privédetective die alle klussen aanneemt, van het vinden van een zwerfkat tot het infiltreren van een streng beveiligd bedrijfslaboratorium. Bovendien lijkt ze letterlijk onverwoestbaar en geneest ze op bovennatuurlijke wijze alle verwondingen en verminkingen. Samen met haar partner Mimi duikt Rin in de donkerste geheimen van de samenleving, maar de geheimen die ze zelf verbergt zijn veel sinister...
Alec, een hof goochelaar die de kroonprins achter de schermen altijd heeft gesteund, wordt plotseling verbannen van het koninklijk hof. Nu hij werkloos is, gaat hij naar de magische academie en ontmoet Yorha, een lid van zijn groep uit zijn schooltijd. In die tijd werd hun groep als legendarisch beschouwd, en deze noodlottige ontmoeting kan niets meer betekenen dan het vullen van de saga met nieuwe avonturen - samen herenigd!
Er is een genocidale maniak met klauwvuisten die de planeet van eindeloze illusie terroriseert, en alleen Van, een eenling met gesloten lippen in een gitzwarte smoking, kan de schurk voor het gerecht brengen. Gewapend met zijn vormveranderende zwaard en een gemechaniseerd harnas, jaagt Van op de slechterik die zijn enige ware liefde heeft vermoord. Met een beetje geluk zal hij de man vinden die hij zoekt voordat de zon ondergaat in de beschaving.
Tijdens het zomerfestival vijf jaar geleden ontmoetten twee meisjes elkaar bij een mysterieuze boom en zagen twee gloeiende bollen. Nu, deze twee meisjes - Saki Hyuga, topwerper in het softbalteam van de school; en Mai Mishou, die liever schetst dan sterren kijken, worden door de geesten van bloemen (Flappy) en vogels (Choppy) gekozen om de zeven fonteinen te herstellen en hun werelden te redden van de donkere herfst. Samen vormen ze de NIEUWE Pretty Cure.