'Stride' is een extreme sport waarbij zes mensen in één team betrokken zijn die estafetteraces door steden lopen. Hōnan Academy en andere scholen strijden om de beste Stride-competitie van Oost-Japan, 'End of Summer', te winnen. Het team van Hōnan is echter gestopt. Eerstejaars middelbare scholieren Takeru Fujiwara en Nana Sakurai proberen de club opnieuw op te starten, maar ze moeten zes leden rekruteren voor het team. Ze vragen Riku Yagami om mee te doen, maar hij wijst ze af door te zeggen dat Stride het enige is dat hij niet wil doen.
Op de 4e dag van de Maand van Jade, Cyndina Era 672, dwingt een staatsgreep in Forland prinses Alita om het kasteel van haar vader te ontvluchten, wanneer ze Falis tegenkomt, de sterkste premiejager in de geschiedenis. Het gerucht gaat dat Falis een draak heeft gedood en wordt vergezeld door Dominikov.
Door een ongeluk vallen Alita en Falis van een klif. In deze bijna-doodervaring overspoelt een licht hen, waardoor hun zielen worden uitgewisseld. Falis, nu in Alita's lichaam, wordt gevraagd om als 'prinses' het land te beschermen. En zo wordt Falis de felste heerser ter wereld, de Moordprinses.
Tokio, 1969. De aarde wordt aangevallen door de 'Invaders'. Het publiek is zich hiervan niet bewust, maar bij de geheime organisatie, A.E.G.I.S., is de dreiging bekend, en het is aan hen en hun speciaal uitgeruste 'Gate Keepers' om deze invasie te stoppen.
Het is dertig jaar na het mislukken van het Ruimte kolonisatieprogramma. De mensheid is bijna uitgestorven. Een eeuwige en dodelijke regen valt op de aarde. Mannen die bekend staan als 'Junkers' plunderen goederen en artefacten uit de ruïnes van de beschaving. Eén zo'n Junker sluipt alleen de gevaarlijkste van alle ruïnes binnen: een 'Sarcofaag stad'. In het centrum van deze dode stad ontdekt hij een vooroorlogs planetarium. En als hij binnenkomt, wordt hij begroet door Hoshino Yumemi, een begeleidende robot. Zonder enige twijfel gaat ze ervan uit dat hij de eerste klant in dertig jaar is die ze heeft. Ze probeert hem meteen de sterren te laten zien, maar de planetarium projector is kapot. Omdat hij geen idee heeft van haar gesprek, stemt hij er uiteindelijk mee in om te proberen de projector te repareren...
Meneer is een 'coyote' of ruimtevarende outlaw die al een jaar in de gevangenis zit voor een verkeersovertreding. Tien dagen voor zijn vrijlating breekt hij uit met de hulp van zijn partners Bishop en Katana. Hij gaat dan op zoek naar Franka die door haar overleden vader onder zijn hoede is achtergelaten en neemt haar mee op een reis om de schat van haar vader te vinden. Op hun hielen zitten de federale rechercheurs Angelica en Chelsea, evenals de androïde huurmoordenaars van de Criminal Guild, Madame Marciano's Twelve Sisters.
Op zoek naar de wereldberoemde goochelaar en familievriend Mamoru Hoshisato gaat de jongen Makoto Shiranui naar Tokio. Hij wil dat hij hem als leerling onder zijn hoede neemt. Sinds hij een show van Mamoru en zijn vrouw zag, droomde hij ervan een goochelaar te worden. Haar dochter Kana - bijgenaamd Hatena - is een jeugdvriendin van Makoto. Hoewel er in Tokio een reeks inbraken is gepleegd door een mooie dief, vindt Makoto gemakkelijk vrede in de aanwezigheid van Hatena. Wanneer hij aankomt bij de Hoshisato-residentie, een spookvilla, begroeten de butler Jeeves en de meid Emma hem en wordt hij herenigd met Hatena. Het blijkt echter dat de twee niet meer zo goed met elkaar overweg kunnen als vroeger.
Akari Kanzaki is zojuist lid geworden van een meisjes academie in de hoop toegang te krijgen tot de University Satellite, een trainingscentrum voor top sport. Ze wil de titel Cosmo Beauty winnen - een titel die haar moeder jaren geleden bekleedde. Het is geen gemakkelijke taak voor haar omdat angst, twijfel en groepsdruk haar in de weg staan, maar vrienden, rivalen en fans moedigen haar langzaamaan aan om haar obstakels te overwinnen en de beste van de Battle Athletes te worden.