Het verhaal draait om negen jongens die lid zijn van de zogenaamde Hikari Club en hun zelfgemaakte robot Litchi. Hun leider is Zera, die een normale student lijkt te zijn, maar in werkelijkheid deze sekteachtige club leidt. Met de hulp van Litchi ontvoeren ze jonge, mooie meisjes... en hun nieuwste doelwit is al gekozen: Kanon.
Er hebben ooit berg hoge beesten bestaan waarvan de overblijfselen mana uitstraalden en mensen aantrokken. Verscheidene jaren gingen voorbij en er brak een oorlog uit tussen de Jerle Federatie, die deze oer beesten aanbidt, en het Gildllan-rijk, waaraan nog geen einde is gekomen. Leo, een jonge ridder kadet van de Federatie, wordt samen met zijn jeugdvriendin Celia en zijn instructeur Lisette op een missie gestuurd naar de voormalige keizerlijke grensstad Lunne. Daar ontmoeten ze Hugo, een oude vriend die zijn land heeft verraden en zich bij het rijk wil aansluiten...
Het verhaal gaat over een jongen die een gewoon leven leidt. Op een dag vindt hij een zeer sterke en intelligente mechanische arm genaamd 'Mecha-ude'. Na enkele vreemde gebeurtenissen wordt “Mecha-ude” een deel van de jongen en begint hun leven vol strijd. De jongen en zijn “Mecha-ude” vechten samen om hun band te versterken. Ze ontmoeten ook nieuwe vrienden die vechten met hun eigen “Mecha-ude”. Hiervan heeft één meisje twee “Mecha-ude” die uit haar rok komen. De twee zullen binnenkort andere “Mecha-ude”-gebruikers tegenkomen die op zoek zijn naar het geheim van “Mecha-ude”.
Chizuru is naar de stad Kyoto gekomen op zoek naar haar vader. Ze werkt samen met de Shinsengumi sinds ze haar heeft gered van een bloeddorstig monster. In juni van Keio's eerste jaar verhuisden de Shinsengumi naar de Nishi Honganji-tempel om hun patrouille in Kyoto voort te zetten en ontvingen ze meldingen van de frequente verschijning van 'bandieten die zich voordeden als Shinsengumi'. Tegelijkertijd kregen ze de taak om Shogun Iemochi te beschermen, die Kyoto bezoekt.
Nadat het leger van het Magic Mineral Empire hun thuisland, het Bloemenrijk, heeft aangevallen, moeten de feeën Himawari en Tsubaki vluchten naar de stad Romangai. Hier leven ze een paar jaar in vrede, maar op een dag wordt Himawari's vriend Ajisai ontvoerd. Himawari en Tsubaki gaan samen op pad om hun vriend te redden, maar de gevreesde soldaten van het Magic Mineral Empire staan hen in de weg!