De Boys Over Flowers-film is geen voortzetting van de serie, maar speelt zich af in een alternatief universum. De belangrijke personages verschijnen allemaal en hun karakters zijn niet veranderd, maar de hele omgeving wel, want dit keer speelt het verhaal zich af in een dansomgeving in plaats van in een eliteschool. Tsukushi is nu een aspirant-dansstudent die een rol probeert te bemachtigen in een grote dansproductie.
De gevaarlijke Dan McGoo (Droopy) wordt geconfronteerd met de wolf, een gevaarlijke outlaw die zijn meisje Lou probeert te stelen tijdens de goudkoorts in Alaska. Losjes gebaseerd op 'The Shooting of Dan Mcgrew' van Robert W. Service.
Shouta wordt via een mysterieus schoolzwembad teruggestuurd in de tijd naar zijn basisschooltijd. Hij ziet Konomi, een meisje dat uiteindelijk een nationaal populaire actrice zou worden, en andere schattige meisjes toen ze onschuldig en weerloos waren.