Iron Man en de Hulk werken samen om de aarde te redden van de grootste bedreiging tot nu toe. Als HYDRA-wetenschappers proberen om een Stark Arc Reactor te overladen met de gamma energie van de Hulk, creëren ze een entiteit van pure energie, genaamd Zzzax. Deze wil alles vernietigen. Iron Man en de Hulk zijn samen de enigen die in de weg staan van Zaxx's globale blackout.
Agent Scott Turner heeft nog drie dagen te gaan voor hij naar de grote stad overgeplaatst zal worden voor het "echte" werk. Wanneer Amos Reed vermoord wordt stort Scott zich op de zaak. De enige getuige is Reed's hond Hooch. Scott moet de zorg voor de hond op zich nemen om te voorkomen dat ze de hond laten inslapen.
SANJAY'S SUPER TEAM volgt de dagdroom van een jonge Indiase jongen, die zich verveelt met de religieuze meditatie van zijn vader, die zich "een soort oude, hindoeïstische versie van The Avengers" voorstelt, met de goden die verschijnen als superhelden.
Astronauten gaan een schijnbaar verlaten onderzoeksschip binnen die in een baan om een zwart gat zijn rondjes draait. Ze vinden aan boord een Captain Nemo-achtig figuur en zijn twee bedienden; een dodelijke robot en een androide klusjesman. De twee blijken onderdeel uitgemaakt te hebben van de originele bemanning, maar zijn door de gekke geleerde, met kwade opzet, zo getransformeerd. Zijn wens is een expeditie door het zwarte gat.
In “The Wolverine” bevindt Logan, de eeuwige krijger en buitenstaander, zich in Japan. Daar zal het staal van een samoerai botsen met het 'adamantium' van Logans klauwen, wanneer deze laatste het moet opnemen tegen een mysterieuze figuur uit zijn verleden in een epische strijd die hem voorgoed zal veranderen.
Wanneer een dreiging die niemand had kunnen verwachten het Marvel-universum treft, heeft deze ongetrainde groep tieners geen andere keuze dan samen op te staan en aan de wereld te bewijzen dat het verschil tussen een 'held' en 'buitenbeentje' soms gewoon in de weg zit. de naam.
Logan en Victor zijn broers en tevens mutanten met bijzondere gaven. Nadat ze als soldaten worden gearresteerd, vraagt kolonel William Stryker het tweetal voor een bijzondere opdracht met een speciaal team van mutanten. Ze besluiten het te doen, maar op een gegeven moment stapt Logan op, om een vredig leven te starten. Als Logan een aantal jaren later echter wordt geconfronteerd met zijn gewelddadige broer Victor, besluit hij opnieuw met Stryker in zee te gaan. Stryker maakt van hem een uitzonderlijke mutant, sterk genoeg om Victor te verslaan. Wolverine is geboren.
Mutanten, mensen met een afwijkende genetische opmaak, die hen zeer bijzondere krachten geeft. Sommige mensen zien het als een geschenk uit de hemel, anderen als een vloek. Professor Charles Xavier en zijn team behoren tot die eerste groep en proberen op Xavier's school jonge mutanten te laten opgroeien met hun speciale krachten. Maar niet iedere mutant gebruikt zijn krachten voor goede doeleinden. Zo wil de mensenhatende Eric Lensherr, alias Magneto, zijn krachten gebruiken om de mensheid uit te roeien. Het is aan Xavier en zijn team om Magneto te stoppen.
Via de mutant Jimmy heeft men een 'geneesmiddel' voor mutatie uitgevonden. Voor het eerst in hun leven hebben mutanten nu een keus: hun krachten, waardoor ze niet geaccepteerd worden door de samenleving, behouden of hun krachten opgeven zodat ze menselijk worden. Ondertussen probeert Magneto een leger mutanten bij elkaar te krijgen om het geneesmiddel te vernietigen en ontdekken Charles Xavier en zijn mutanten dat Jean Grey terug is. Maar ze is niet helemaal zichzelf.
In de roerige jaren 80 wordt rechercheur Jurre de Cock gestationeerd in het rauwe politiestation op de Warmoesstraat in Amsterdam. Samen met zijn nieuwe partner Tonnie Montijn stuit De Cock op een moordzaak die leidt naar een mogelijke aanslag tijdens de kroning van prinses Beatrix. Ze moeten alles op alles zetten om een drama op de kroningsdag te voorkomen.
Wanneer een onbekende, vermoedelijk een mutant met buitengewone krachten, de president aanvalt krijgen de mutanten met nog meer argwaan en discriminatie te maken dan al het geval was. Er komt bredere steun in de samenleving voor een registratieplicht voor mutanten. Militair leider William Stryker is één van de grootste voorstanders van dit plan, en leidt een aanval op de X-Men opleiding. De ontsnapte Magneto begint een opmerkelijke samenwerking met Professor Xavier om Stryker te stoppen. Ondertussen begint Wolverine een onderzoek naar zijn verleden.