In Together 99 brengt regisseur Lukas Moodysson de cast van Together opnieuw bij elkaar om vierentwintig jaar na de oprichting van de Tillsammans-commune de balans op te maken. Het is inmiddels 1999 en Klasse en Göran zijn de enige twee overgebleven leden van de groep. Om hun lusteloosheid wat te temperen, nodigt Klasse voor Görans verjaardagsfeest stiekem voormalige leden van de commune uit. Terwijl de vrienden van vroeger op een veelbewogen avond bijpraten, komen zowel oude littekens als nieuwe hoopvolle verhalen aan het licht.
Tijdens de vakantie werken Megan en haar beste vriendin Julia samen met Eddy bij de stal van de bikkelharde paardenhandelaar Alex. Megan heeft er altijd van gedroomd om een succesvolle dressuurrijder te worden. Dan komt Whitestar op Megans pad, een paard waarmee zij een bijzondere band opbouwt, maar dat voor Alex een onhandelbaar paard blijft. Wanneer hij hem weg wil doen, kan Megan hem maar net van zijn ondergang redden. Als het paard dan toch over bijzondere talenten te beschikken, eist de onredelijke Alex zijn paard terug, maar zonder succes. Wanneer een aantal jaren later Megan, Julia en Eddy Whitestar toevallig tegenkomen op een dressuurwedstrijd, blijkt de band tussen Megan en Whitestar onafscheidelijk.
Emma is bijna jarig. Ze wordt vijf. Wat ze het liefste wil voor haar verjaardag is een hond. Maar haar moeder vindt dat ze nog niet groot genoeg is om voor een hond te zorgen. Intussen ziet Casper, net zo oud als Emma, er heel erg tegenop om voor het eerst naar school te gaan. Daar maakt hij kennis met Emma. Ze hebben allebei een knuffel bij zich: Casper een leeuwtje en Emma een konijn. De twee kinderen sluiten direct vriendschap en de knuffels ook. Op een dag zien Emma en Casper een lieve hond die Bassa heet. Emma is gek op het dier en wil Bassa meteen mee naar huis nemen. Haar konijn ziet groen van jaloezie en verstopt zich. Emma is bang dat ze haar knuffel nooit meer zal zien. Ze is erg verdrietig. Als ze dan eindelijk jarig is krijgt ze niet één grote verrassing maar twee!
Mina's leven staat op zijn kop wanneer ze verneemt dat haar man Babak onschuldig was aan de misdaad waarvoor hij werd geëxecuteerd. De autoriteiten verontschuldigen zich voor de vergissing en bieden financiële compensatie in het vooruitzicht. Mina begint een stille strijd tegen een cynisch systeem voor haar eigen bestwil en dat van haar dochter. Net als haar geld opraakt, klopt een vreemdeling genaamd Reza bij haar aan, die zegt dat hij een schuld aan Babak komt aflossen. Mina is aanvankelijk terughoudend, maar laat Reza steeds meer in haar leven toe, zich niet bewust van het geheim dat hen met elkaar verbindt.
Een verlegen, staartloos katje genaamd Pelle vindt een nieuw thuis bij het meisje Birgitta, maar dan blaast een plotselinge storm hem richting de grote stad, waar hij allerlei avonturen beleeft met aardige, maar ook minder aardige mededieren. Uiteindelijk leert Pelle zijn nieuwe vrienden dat het veel moediger is om aardig te zijn dan gemeen te blijven doen.
Sylvia (Thekla Reuten) en haar man Eddie (Jeroen van Koningsbrugge) leiden een luxeleventje in Amsterdam Oud-Zuid met hun twee kinderen. Wat de bron van die luxe is, heeft Sylvia verdrongen. Want Eddie houdt zijn bloeiende drugshandel buiten de deur. Een brutale politie-inval en vernederende huiszoeking schudden Sylvia wakker. Wanneer alles fout dreigt te lopen probeert Sylvia haar jonge kinderen te beschermen en het misdaadmilieu te ontvluchten. Maar zo gemakkelijk gaat dat niet, want ze beseft dat Eddie haar niet zomaar zal laten gaan. Ze weet immers te veel.
Op missie in Afghanistan leidt Marco Kroon zijn manschappen op heldhaftige wijze door vuurgevechten. Hij ontvangt daarvoor de hoogste onderscheiding die Nederland kent: de militaire Willems-Orde. In de jaren erna raakt Kroon echter in opspraak. Tegelijk worstelt de militair met trauma’s die hij zelfs met zijn liefde Mirjam niet kan delen en in de media en op straat heeft iedereen een mening over hem. Kroon belandt in een emotionele rollercoaster. Wanneer hij zijn gelijk probeert te bewijzen, staat hij misschien wel voor zijn moeilijkste missie ooit.
Yasmine heeft maar één droom: een succesvol advocaat te worden. Ze werkt er keihard voor, maar haar omgeving maakt zich zorgen om haar vrijgezelle status. Een man vang je nu eenmaal eerder met een kookboek dan met een wetboek. Aangemoedigd door haar vriendinnen dwingt Yasmine zichzelf om open te staan voor de liefde en dan vindt ze plots niet één, maar zelfs twee leuke mannen op haar pad. Terwijl in haar omgeving het ene na het andere bruiloftsfeest gevierd wordt, groeien Yasmine’s twijfels. Waar de succesvolle arts steeds meer op haar zenuwen werkt, is de stoere monteur ineens haar cliënt in de rechtbank. Hoe weet ze zeker dat ze de juiste keuze maakt?
Als de familie Vos aankomt in de Efteling voor een jaarlijks weekendje samen, ontdekt de elfjarige Teun dat zijn pas overleden opa, die hij heel erg mist, daar nog een laatste puzzeltocht voor hem achter heeft gelaten. Hoewel de meeste volwassenen denken dat dat onzin is, gaat Teun samen met zijn bijzondere tante Ada op een expeditie door het attractiepark om erachter te komen wat zijn opa precies voor hem heeft verstopt. Ze worden echter dwars gezeten door een mysterieus figuur.
Achtervolgd door de dood van haar broer, keert Emma terug naar haar geboorteplaats en blaast een oude passie nieuw leven in met Tommy, een lokale kreeftenvisser.
2025. De space shuttle Atlantis manoeuvreert in de ruimte wanneer zich een onverklaard fenomeen voordoet. De bemanningsleden zijn druk bezig met het repareren van fouten en worden naar een wilde planeet voortgestuwd die op één van hen na onbekend is. Gedesoriënteerd proberen de astronauten te begrijpen wat er met hen gebeurt als ze een voor een bezwijken voor een onbekende kracht. Een hangende, versnelde bevriezing, de aanval van een onzichtbaar wezen... Wat als dit, hoe wreed het ook is, slechts een spel was, een soort experiment waarin de astronauten de proefkonijnen zijn?
Casper en Emma zitten op de kleuterschool. Ze praten in de klas over een weeshuis in India dat geen elektriciteit heeft. Op een dag gaan ze met de opvoeders naar het theater. Het wordt voor de twee kinderen een opwindende kennismaking met theaterpoppen. Daarna zijn ze erg enthousiast en willen ze zelf een toneelstuk maken over kaarsen die licht brengen in het donker. Ze willen dit doen om geld in te zamelen voor het weeshuis.
Er is veel veranderd in de levens van onze mannen, maar ook in Mannenharten 2 blijkt de liefde weer alles behalve een sprookje. Zo drijft de baby van Wouter en Nicole hen vooral uit elkaar. Als beginnend kinderboekenschrijfster heeft ze vooral oog voor haar leuke boeken en dito uitgever. Met als gevolg dat Wouter zich nog één keer in het onbezonnen studentenleven stort. Samen met Tim, die net terug is van zijn reis en besloten heeft een tijdje single te blijven, wat makkelijker gezegd is dan gedaan. Dennis valt als een blok voor een nieuw zangtalent, maar zij laat zich niet zo makkelijk inpakken. Evenals Niels, die besluit het na een versiercursus over een hele andere boeg te gooien. En dan is er nog de hopeloos romantische Younes, die op zoek is naar het meisje waar hij één onvergetelijke nacht mee beleefde. Kortom: de zoektocht naar liefde gaat in alle hevigheid verder!
Na Leedvermaak en Qui Vive is de oude Simon op sterven na dood en treedt er een nieuwe generatie op de voorgrond van de veelgeplaagde Joodse familie die de sporen van WO II maar niet uit hun onderlinge relaties verbannen krijgt. De familie is bijeen gekomen omdat stamvader Simon ernstig ziek is. Hij heeft een oogoperatie ondergaan die ernstige complicaties heeft veroorzaakt. Zijn overleden vrouw Ada is - voor de anderen onzichtbaar - aanwezig wanneer er aan haar gedacht wordt. Simon denkt bijna voortdurend aan haar, zowel in de werkelijkheid als in zijn 'dagmerries'.
Vijf (overgebleven) monniken leiden een vredig harmonieus leven in het klooster van Wanroi. Daar komt abrupt een einde aan als hun klooster verkocht dreigt te worden aan de gemeente die er een commercieel welnesscentrum van wil maken. De broeders proberen van alles om dit tegen te houden, maar alle pogingen mislukken jammerlijk totdat er een Wonder gebeurt! Ze zijn voorlopig gered, maar hun leven staat vanaf dan totaal op zijn kop...
Sia is een jonge, charmante, maar ook een beetje brutale fee. Op een dag verlaat ze haar huis in het bos op weg naar de stad. Sia is onder de indruk van de georganiseerde stedelijke vormen en ordelijke gewoonten die de stadsmensen hebben. Ze ontmoet er een nieuwe vriend, de eenzame zachtaardige mensenjongen Alfred. Op een dag liggen er dode vogels in de straten van de stad. Alfred en Sia gaan op onderzoek uit.
Casper en Emma gaan op safari naar Afrika. Daar werken Emma's moeder en haar vriendin Ann als dierenarts in Camp Eden. Samen met Emma's opa en hun knuffels Mevrouw Konijn en Welpje verheugen ze zich op het zien van de dieren daar.
Met de hulp van een beschermengel komt een verwend en rijk meisje tot de ontdekking dat echte waarde gevonden kan worden in het helpen van anderen en niet in materiële dingen.