In september 1944, nadat het 501st Joint Fighter Wing Strike Witches squadron de Neuroi-dreiging boven Gallia had geneutraliseerd en West-Europa had bevrijd, begonnen de geallieerde troepen een tegenaanval in Midden- en Oost-Europa. De hoop van de mensheid ligt nu op de 502nd Joint Fighter Wing – de Brave Witches. Vanuit Petersburg in het Orussische rijk lanceren deze tien heksen hun offensief onder de koude hemel van Oost-Europa.
Nadat Keigo Atobe en Hyotei Academy het WK hadden gewonnen, keerden de spelers terug naar huis. Maar wanneer Atobe en zijn team een gloednieuwe tennisbaan voor de Hyotei willen bouwen, worden Yukimaru en de rest van het Rikkai-team geselecteerd om voor de eerste keer tegen hen te strijden. Kunnen de kampioenen van de troon worden verdreven? Het spel begint!
Als Natsuki aan het begin van het nieuwe schooljaar wordt gevraagd bij welke schoolclub ze lid wil worden, antwoordt ze: 'De go-home club'. Het blijkt dat dit echt bestaat en dus wordt ze daar tegen haar wil lid. Ook haar vriendin Karin sluit zich aan bij deze club, die tot dan toe slechts drie leden telde: Sakura Doumyouji, Botan Oohagi en Claire Kokonoe. Hun activiteiten beperken zich tot discussies over vrijwel alles, grappen en spelletjes.
De komedie draait om Sayuri Satou, de nieuwe receptiemedewerker van het Sparrow's Hotel, 'het hotel dat het dichtst bij de hemel ligt'. Haar bijzondere kenmerken zijn haar grote borsten en haar moordvaardigheid. Met die vaardigheden haalt ze mensen neer die problemen veroorzaken in het zakenhotel, maar ze is in feite zeer onvaardig in het praten met de mannelijke hotelmanager en bijt vaak op haar tong.
Het is de terugkeer van de vreemde internet mascotte genaamd Wooser. Geel en zwart van kleur, hoewel schattig, bevat het een persoonlijkheid die gecorrumpeerd is door geld, vlees en meisjes. Wat heeft hij nog meer voor ons in petto?
De serie is een parodie op de consoleoorlogen en vertelt het verhaal van twee naties, het Segua-koninkrijk en het Ninteldo-rijk, die verwikkeld zijn in een strijd om dominantie over het land Consume.