Het verhaal begint met het populaire online spel Yggdrasil, dat op een dag in het jaar 2138 zal worden afgesloten. Momonga, de hoofdpersoon, wil echter niet uitloggen. Als gevolg hiervan wordt Momonga getransformeerd in een krachtige skeletmagiër. De wereld van Yggdrasil verandert dan, waardoor NPC's ineens emoties en een eigen bewustzijn krijgen.
Zonder ouders, vrienden of een plaats in de samenleving probeert deze jongeman de nieuwe wereld te veroveren die is ontstaan uit het spel Yggdrasil.
Weinig mensen kennen de waarheid: de wereld is veilig dankzij de Magische Meisjes die gedwongen worden heksen te doden. Hoewel deze meisjes hun leven op het spel zetten voor een wens, gaan er geruchten dat ze gered kunnen worden in Kamihama City. Dat is waar Iroha Tamaki naartoe gaat op zoek naar antwoorden; ze kan zich de wens die ze aan Kyubey heeft gedaan niet herinneren.
Tien jaar na de Ceremoniële Strijd vertrekt een tienerjongen genaamd Judai Yuuki (Jaden Yuki) om zich aan te sluiten bij de Duel Academia (Duel Academie) op een afgelegen eiland voor de kust van Japan. Daar ontmoet hij zijn medestudenten en krijgt hij een paar vrienden, maar ook een paar vijanden. Judai wordt ingedeeld in de laagste rang, Osiris Red (Slifer Red), maar hij blijft zijn vaardigheden testen tegen de studenten en docenten om zijn waarde als Duelist te bewijzen en het respect van iedereen om hem heen te verdienen.
Tsuyoshi Mukohda, een gewone salarisman, wordt op een dag plotseling naar een andere wereld getransporteerd. De unieke vaardigheid die hij opdoet bij aankomst in deze wereld is de schijnbaar nutteloze 'Online Grocery'. Mukohda is in eerste instantie ontmoedigd, maar het moderne voedsel dat hij met deze vaardigheid naar zijn nieuwe wereld kan brengen, blijkt ongelooflijke effecten te hebben!
Echizen Ryoma is een jong tenniswonder dat vier opeenvolgende tenniskampioenschappen heeft gewonnen, maar voortdurend in de schaduw staat van zijn vader, een voormalig proftennisser. Hij gaat naar de middelbare school Seishun Gakuen, een van de beste tennisscholen in Japan, en daar leert hij samen met zijn teamgenoten zijn eigen type tennis te vinden in een poging zijn grootste obstakel van allemaal te overwinnen: zowel zijn vader als hijzelf.
In de periode van de Strijdende Staten van het oude China (475–221 vGT) zijn Shin en Hyou oorlogswezen in het koninkrijk Qin. Ze dromen ervan zichzelf ooit te bewijzen op het slagveld. Op een dag wordt Hyou echter door een minister naar het paleis gebracht. Hyou belandt aan de verliezende kant van een machtsstrijd en slaagt erin om nauwelijks levend terug te keren naar het dorp. Shin ontmoet dan een jongen die sterk op Hyou lijkt, Ei Sei. Voorlopig is hij de koning van Qin; later zal hij keizer Shi Huangdi worden.
In de niet al te verre toekomst: de mensheid wordt gedwongen bescherming te zoeken tegen de ergste dreiging tot nu toe in mobiele forten die plantages worden genoemd. Het enige effectieve wapen tegen de beesten die herhaaldelijk menselijke nederzettingen aanvallen zijn de Franxx, krachtige gevechtsrobots die worden bestuurd door een mannelijke en een vrouwelijke piloot. Eén van de kandidaten voor de volgende generatie Franxx-piloten is Hiro, die ooit werd beschouwd als een wonderkind, maar de laatste tijd bij geen enkele poging een geschikte partner heeft gevonden en daarom op het punt staat met pensioen te gaan. Wanneer hij de startceremonie overslaat om in plaats daarvan zijn gedachten in een bos na te streven, ontmoet hij een gehoornd meisje dat zichzelf voorstelt als Zero Two en hem bekend voorkomt...
Takemichi Hanagaki is een freelancer die de absolute wanhoop in zijn leven heeft bereikt. Hij komt erachter dat de enige vriendin die hij ooit op de middelbare school had, Hinata Tachibana, was vermoord door de meedogenloze Tokyo Manji Gang. De dag nadat hij over haar dood heeft gehoord, staat hij op het perron van het station en wordt hij door een kudde mensen het spoor op geduwd. Hij sluit zijn ogen en denkt dat hij op het punt staat te sterven, maar toen hij zijn ogen weer open deed, is hij twaalf jaar terug in de tijd gegaan. Nu hij terug de beste dagen van zijn leven beleeft, besluit Takemichi wraak te nemen.
Denji heeft een simpele droom: een gelukkig en vredig leven leiden en tijd doorbrengen met een meisje dat hij leuk vindt. Dit staat echter ver af van de realiteit, aangezien Denji door de yakuza wordt gedwongen duivels te doden om zijn verpletterende schulden af te betalen. Met zijn duivel Pochita als wapen is hij bereid alles te doen voor een beetje geld.
Kobayashi woont alleen in een appartement, totdat Tohru op een dag verscheen en ze uiteindelijk samen gingen wonen. Tooru kijkt neer op mensen als inferieur en dwaas, maar nadat ze is gered door Kobayashi-san, doet ze er alles aan om de schuld terug te betalen en haar met verschillende dingen te helpen, hoewel niet alles volgens plan verloopt.
Kaede Honjou wordt door haar vriendin Risa Shiramine uitgenodigd om met haar een virtual reality MMO-game te spelen. Hoewel Kaede niet van games houdt, heeft ze er echt een hekel aan om pijn te hebben. Ze creëert een personage genaamd Maple en besluit al haar punten in VIT te stoppen om de pijn te minimaliseren. Als gevolg hiervan beweegt ze langzaam, kan ze geen magie gebruiken en kan zelfs een konijn het beste uit haar halen. Maar het blijkt dat ze een vaardigheid verwerft die bekend staat als 'Absolute Defense' als gevolg van het pompen van punten in VIT, evenals een 'Counter Skill' die speciale bewegingen tegengaat. Nu ze alle schade ongedaan kan maken, gaat ze op avontuur.
Makoto Misumi is een gewone middelbare scholier die een normaal leven leidt, maar plotseling naar de andere wereld wordt geroepen om een 'held' te worden. De godin van de andere wereld beledigt hem echter omdat hij anders is en ontneemt hem de titel van 'held', voordat hij hem wegstuurt naar de wildernis aan de rand van de wereld. Terwijl hij door de wildernis dwaalt, ontmoet Makoto draken, spinnen, orcs, dwergen en allerlei niet-menselijke stammen. Omdat Makoto uit een andere wereld komt, kan hij onvoorstelbare magische krachten en gevechtsvaardigheden ontketenen. Maar hoe zal hij omgaan met zijn ontmoetingen met verschillende soorten en overleven in zijn nieuwe omgeving? In deze fantasie probeert Makoto de andere wereld in een betere plek te transformeren, ondanks dat de mensen en goden hem de rug hebben toegekeerd.
De Asahigaoka School is een combinatie van een basis- en middelbare school, gelegen in een afgelegen dorp. De school heeft slechts vijf leerlingen; vier meisjes en een jongen. De vier meisjes zijn beste vriendinnen en brengen hun tijd door met klassieke activiteiten zoals het oogsten en verzamelen van bergkruiden of vis.
Ashito Aoi is een jonge, aspirant-voetballer uit een achtergebleven stadje in Japan. Zijn hoop om naar een middelbare school te gaan met een goede voetbalclub wordt de bodem ingeslagen wanneer hij een incident veroorzaakt tijdens een kritieke wedstrijd voor zijn team, wat resulteert in hun verlies en uitschakeling van het toernooi. Toch trekt hij de aandacht van een belangrijk iemand die toevallig op bezoek was vanuit Tokio. Hoe zal het aflopen met Ashito?
In de magische wereld is magie alles: iedereen kan het gebruiken, en iemands sociale status wordt bepaald door zijn vaardigheidsniveau. Diep in het bos, zich niet bewust van de gang van zaken in de wereld, leeft Mash. Dankzij zijn dagelijkse training is hij een fitnessgod geworden, maar hij herbergt een geheim dat zijn leven op zijn kop zou kunnen zetten: hij kan geen magie gebruiken! Als hij erachter komt, wordt hij, in plaats van dat zijn leven voorbij is, onverwachts ingeschreven op de magische school, waar hij de concurrentie moet verslaan!
Kotoko Iwanaga werd de god van de wijsheid voor de bovennatuurlijke wezens en brengt haar dagen door met het oplossen van problemen voor hen. De jongen op wie ze verliefd werd, Kuro Sakuragawa, is echter iemand die door alle bovennatuurlijke wezens wordt gevreesd. De twee worden geconfronteerd met verschillende mysterieuze incidenten waarbij het bovennatuurlijke betrokken is in deze serie liefde x romantiek x mysterie. Waar zullen deze fantastische incidenten hen naartoe leiden en wat zal er gebeuren met Kotoko’s verliefdheid?
Koichi Haimawari kon het niet redden om een officiële held te worden, dus gebruikt hij zijn bescheiden Quirk om goede daden te doen in zijn vrije tijd. Op een dag leidt een noodlottige ontmoeting met enkele lokale misdadigers ertoe dat hij samenwerkt met twee andere onwaarschijnlijke helden. Geen van hen weet echt wat ze doen, maar ze hebben de moed - of dwaasheid - om het te proberen. Maar ze ontdekken al snel dat er meer nodig is om het kwaad te bestrijden dan alleen dapper zijn...
Een deur naar een andere wereld strekt zich uit voor een jongen die zijn hele leven op brute wijze is gepest. Deze alternatieve realiteit geeft hem toegang tot allerlei dingen, zoals vaardigheden om te bedriegen en een portaal waarmee hij tussen zijn oude en nieuwe werelden kan reizen! Kan deze klasse verliezer zijn leven thuis veranderen...?