Ergens in de 22e eeuw hebben mensen Venus en Mars volledig geterraformeerd en gekoloniseerd. De Neosapiens, een kunstmatig gemanipuleerd ras dat is gemaakt om slaven te zijn voor de Terrans, hebben zich tegen hun meesters gekeerd en hebben de Neosapien Orde/Empire/Commonwealth gevormd. Onder het bewind van de berekenende gouverneur-generaal Phaeton hebben de Neosapiens een invasie van de aarde en Venus gelanceerd. De ExoFleet, de ruimtemarine van de Homeworlds (in het bijzonder Able Squad, een groep Exo-Frame-piloten onder leiding van luitenant J.T. Marsh), vecht tegen de invasie in een interplanetaire oorlog om de Terranen te beschermen.
Engeland, 18e eeuw. Wanneer Nell Jackson wordt beschuldigd van moord, wordt ze gedwongen tot een leven vol roofovervallen, samen met haar twee weeszusjes Roxanne en George. Geholpen door een moedige kleine geest genaamd Billy Blind, realiseert Nell zich dat het lot haar om een reden aan de verkeerde kant van de wet heeft geplaatst. Een reden die veel groter is dan ze zich ooit had kunnen voorstellen, een reden die tot aan koningin Anne reikt.
Wanneer een astronaut verdwijnt, gaat haar familie op zoek naar antwoorden. Maar hoe meer haar familieleden ontdekken, hoe groter het gevaar wordt voor hen − en voor de wereld.
De serie draait om de avonturen van een jonge Superman in de 31e eeuw, waarin hij vecht aan de zijde van een groep futuristische superhelden die bekend staat als de Legion of Super-Heroes.