Vier jaar na de gebeurtenissen in de eerste Jurassic Park film verklapt John Hammond aan Ian Malcolm dat er nog een ander eiland was vol dino's. Deze zijn verder met rust gelaten, en Hammond is erg benieuwd naar de dieren in een natuurlijke omgeving.
Een tektonische verschuiving diep onder de Marianentrog veroorzaakt een reeks steeds escalerende aardbevingen. Als een team van vooraanstaande seismologen er niet in slaagt de ramp te stoppen, zullen de gebeurtenissen de aarde uiteenvallen, met miljarden slachtoffers tot gevolg. Eindelijk heeft iemand aandacht voor onze vooraanstaande seismologen.
Via de mutant Jimmy heeft men een 'geneesmiddel' voor mutatie uitgevonden. Voor het eerst in hun leven hebben mutanten nu een keus: hun krachten, waardoor ze niet geaccepteerd worden door de samenleving, behouden of hun krachten opgeven zodat ze menselijk worden. Ondertussen probeert Magneto een leger mutanten bij elkaar te krijgen om het geneesmiddel te vernietigen en ontdekken Charles Xavier en zijn mutanten dat Jean Grey terug is. Maar ze is niet helemaal zichzelf.
In dit bloedstollende vervolg op The Jurassic Games nemen tien terdoodveroordeelden opnieuw deel aan een dodelijke VR-show waarin ze tegen dinosaurussen strijden voor een tweede kans op leven. Maar wanneer het systeem faalt, wordt de slachtpartij bittere werkelijkheid. Met een nieuwe presentator en nóg hogere inzet is overleven geen spel meer, het is de enige optie.
Wanneer een onbekende, vermoedelijk een mutant met buitengewone krachten, de president aanvalt krijgen de mutanten met nog meer argwaan en discriminatie te maken dan al het geval was. Er komt bredere steun in de samenleving voor een registratieplicht voor mutanten. Militair leider William Stryker is één van de grootste voorstanders van dit plan, en leidt een aanval op de X-Men opleiding. De ontsnapte Magneto begint een opmerkelijke samenwerking met Professor Xavier om Stryker te stoppen. Ondertussen begint Wolverine een onderzoek naar zijn verleden.
Dr. Alan Grant wil graag zijn dinosaurus-onderzoek voortzetten. Hij wordt door de rijke avonturier Paul Kirby en zijn vrouw Amanda uitgenodigd om als gastheer op te treden bij een tour over Isla Sorna.
Provincie Buenos Aires, Argentinië, 2101. De wereld is geteisterd door een biologische oorlogvoering. Een man wordt wakker in de woestijn en kan zich niets herinneren van zijn vorige leven.
Joshua heeft een goede band met zijn tweelingzus Emma. Hij moet haar beschermen omdat ze een bovennatuurlijke gave heeft. Een niet te stoppen geheimagent is bezig met een topgeheim overheidsexperiment en opent de jacht op Emma. Joshua moet voorkomen dat hij Emma te pakken krijgt.
Een groep ervaren mariniers steelt een lading wapens van het leger, maar vindt een robot uit de Koude Oorlog die hen achtervolgt, vastbesloten om zijn missie te vervullen. Niets kan deze dodelijke moordmachine stoppen.
2123, de mensheid leeft in steden onder beschermende koepels en kan alleen overleven door op 50-jarige leeftijd te transformeren in een boom die weer dient als zuurstof en voedsel. Als Stefan ontdekt dat zijn geliefde Nora zich vrijwillig heeft aangemeld, ruim voor haar tijd, gaat hij op een avontuurlijke reis om haar ten koste van alles te redden en overtreedt alle regels van het systeem.