De hoofdpersoon stopt in haar tweede jaar met de middelbare school en wil naar de universiteit gaan terwijl ze alleen in Tokio werkt. Een meisje wordt verraden door haar vrienden en weet niet wat ze moet doen. Een ander meisje wordt door haar ouders in de steek gelaten en probeert in de stad te overleven door parttime te werken. Deze wereld laat ons voortdurend in de steek. Niets gaat zoals gepland. Maar we willen iets dat we leuk kunnen blijven vinden. Wij geloven dat er een plek is waar we thuishoren. Daarom zingen wij.
Middelbare scholier Kimichika Haijima verhuist terug naar zijn geboorteplaats Fukui nadat hij problemen heeft veroorzaakt voor de volleybalclub Tokyo Junior High School. Daar wordt hij herenigd met zijn jeugdvriend Yunii Kuroba, die over uitstekende fysieke capaciteiten beschikt, maar deze onder druk niet kan gebruiken. Hajima vormt met zijn overweldigende passie en talent voor volleybal een topduo samen met Kuroba.
De wereld kan genezen worden door middel van muziek, en deze drie meiden willen dat waarmaken. Maak kennis met Kana Fujii, Reimi Itsushiro en Hibiki Morishima – drie genezers in opleiding bij de Karasuma Phoniatric Clinic die de kunst leren van het genezen van ziekten en verwondingen van patiënten door te zingen. Ga met ze mee op dit muzikale avontuur vol goedhartige, krachtige wonderen, gezongen om de wereld te genezen.
Met het scheiden van zijn ouders woonde Haru Kaidou de eerste acht jaar in Canada, bij zijn moeder, een schrijver, voordat hij vertrok om in Japan te gaan wonen bij zijn vader, die op zijn beurt zijn leven herbouwde met een andere vrouw en hem twee kleine broertjes gaf.
De jonge Ikuta Sorouku woont in het koninkrijk Katvarna, dat in oorlog is met het buurland Kioka. Hij staat er eigenlijk om bekend dat hij nogal lui is, maar door bepaalde omstandigheden neemt hij deel aan het militaire examen. Dit was het beste wat hij met zichzelf kon doen, want de 17-jarige groeit op tot een groot soldaat die door iedereen Groot commandeur wordt genoemd. Door zijn superieure intellect weet hij te overleven in oorlog.
De democratische natie Patria werd opgericht op het continent Patria. Vanwege economische geschillen splitste het land zich op tussen het noorden en het zuiden, waardoor de Noordelijke Unie van Patria en de Zuidelijke Confederatie van Patria ontstonden, en ze voerden een lange burgeroorlog. Nu hun aantal afneemt, besluit het Noorden verboden technologie te gebruiken om het Zuiden te verslaan. Deze technologie verandert mensen in monsterachtige soldaten, waardoor ze bijna goddelijke krachten krijgen. En met die bevoegdheden kwam er een einde aan de lange oorlog en werd de vrede hersteld.
Nozomi Yumehara liet haar gewone middelbare schoolleven achter zich toen zij en haar vrienden begiftigd werden met magische krachten om de krachten van het kwaad te stoppen. Na enkele jaren ontmoeten ze elkaar nu als volwassenen – elk meisje leidt haar eigen leven als volwassen vrouw met familie, dromen en uitdagingen. Maar een sombere schaduw rijst op in de duisternis en dreigt de gezellige wereld die ze kennen en liefhebben in chaos te storten. Verenig je, PreCures, en red de wereld opnieuw!
De setting van de anime is een fictieve Japanse stad genaamd Sugomori City. Op een dag zegt Noriko Sonosaki tegen haar klasgenoot Katsuhira Agata: 'Je bent geselecteerd om Kiznaiver te worden.' Het Kizuna-systeem, waarmee Katsuhira zijn wonden kan delen, verbindt hem met klasgenoten wier levens en persoonlijkheden totaal verschillen van de zijne. Het Kizuna-systeem is een onvolledig systeem voor de implementatie van wereldvrede dat mensen door middel van wonden met elkaar verbindt. Iedereen die op dit systeem is aangesloten, wordt Kiznaiver genoemd. Wanneer een Kiznaiver gewond raakt, verdeelt het systeem de wond en verzendt deze naar de andere Kiznaiver. Sugomori City is gebouwd op teruggewonnen land, maar naarmate de jaren verstrijken neemt de bevolking van de stad af. Het verhaal speelt zich af in deze stad waar Katsuhira en de anderen wonen.
Yuichi heeft zijn neef Nayuki al jaren niet meer gezien. Nu hij terug is, is alle kennis van zijn bezoeken verdwenen. Hij probeert zich aan te passen aan de vaag vertrouwde omgeving, maar de gaten in zijn geheugen achtervolgen hem naarmate de tijd dringt. De stukjes van de puzzel zijn verschenen – een griezelig stille schoonheid met vlammende lokken, het mysterieuze meisje met de gevleugelde rugzak en de zwaard zwaaiende demonen doder – maar het is aan Yuichi om te ontdekken hoe ze in elkaar passen.
Het speelt zich af in een fictief Europees land in 1924. Een Japanse uitwisselingsstudent ontmoet een mysterieus, briljant meisje dat de bibliotheek alleen verlaat om te slapen. Haar broer, een detective, vertrouwt op haar uitzonderlijke geest om moeilijke mysteries op te lossen.
Rin Asōgi ziet er aan de buitenkant misschien uit als een gewone kantoordame, maar ze is eigenlijk een privédetective die alle klussen aanneemt, van het vinden van een zwerfkat tot het infiltreren van een streng beveiligd bedrijfslaboratorium. Bovendien lijkt ze letterlijk onverwoestbaar en geneest ze op bovennatuurlijke wijze alle verwondingen en verminkingen. Samen met haar partner Mimi duikt Rin in de donkerste geheimen van de samenleving, maar de geheimen die ze zelf verbergt zijn veel sinister...
Mensen vechten om hun land te beschermen tegen binnenvallende demi-menselijke stammen in meedogenloze gevechten. Terwijl zijn wereld wordt overspoeld door intense oorlogvoering, sluit Kai, een dorpsjongen uit Lag, zich aan bij het gevecht om alles wat hij heeft te verdedigen. Nadat Kai's kameraden één voor één zijn gevallen en hij gewond is geraakt, herinnert hij zich plotseling herinneringen uit een ander leven. Een fantasie verhaal ontvouwt zich terwijl een dorpsjongen een wereld van magie, mysterie en heldendom onderzoekt.