Terwijl een meedogenloze indringer dreigt hun volk tot slaaf te maken en de Kaaba, een heilig heiligdom, te vernietigen, neemt het volk van Mekka de wapens op. Omdat ze slechts een kleine strijdmacht kunnen verzamelen tegen het enorme leger, lijkt een nederlaag vrijwel onvermijdelijk. Aus, een ogenschijnlijk eenvoudige pottenbakker die vecht om zijn familie te beschermen, wordt gedwongen zijn duistere verleden te onthullen. Abraha's leger nadert snel en het lot van Mekka en zijn inwoners staat op het spel. Zullen de inwoners van Mekka het kolossale leger verslaan met niets anders dan hun eenvoudige verdedigingswerken en hun liefde voor hun stad?
Hoewel hij getraumatiseerd is door getuige te zijn van de moord op zijn ouders door een van de Choushuu, leidt Ichimura Tetsunosuke"s dorst naar wraak hem naar kracht. Op 15-jarige leeftijd benaderde Tetsunosuke de Shinsengumi en wilde een van hun leden worden. Tetsunosuke miste echter de vaardigheid, het verstand en de wil om emotioneel iedereen neer te slaan die de vrede en de Shinsengumi bedreigde. Zelfs met de steun van zijn broer Tatsunosuke en zijn nieuwe vrienden van de Shinsengumi, wist Tetsunosuke niet hoeveel bloed en pijn hij zou moeten doorstaan als hij deel uitmaakte van deze historische groep.
De cyborg Kisaragi wordt achtervolgd door een organisatie van onsterfelijke vampiers die een verdeeld Tokio willen veroveren. De yakuza beloven hun vermoorde baas te wreken en de strijd aan te gaan.
We zitten in het jaar 2314, 2 jaar nadat de A-LAWs zijn verslagen. De New Earth Federation heeft vrede proberen te realiseren via de afschaffing van wapens op de planeet. Een lang vergeten ruimteschip dat naar Jupiter was gestuurd 130 jaar geleden komt terug zonder een schijnbaar teken van leven. Maar ondertussen zit er een nieuwe buitenaardse bedreiging aan boord; de Extraterrestrial Living-metal Shapeshifters (ELS). De Celestial Being komt terug om de aarde en de mensheid tegen deze nieuwe dreiging te beschermen.
Lelouch alias Zero staat met zijn rug tegen de muur: niet alleen is zijn kleine zusje Nunnally, die alles voor hem betekent, ontvoerd en zijn voormalige beste vriend Suzaku negeert al zijn hulpkreten, ook de Orde van de Zwarte Ridders lijkt te zijn langzaam het vertrouwen in hun leider verliezen. Lelouchs hoop om zijn vader, de keizer, omver te werpen, vervaagt. De enige optie die hem rest in dit alles-of-niets-politieke schaakspel is het verslaan van het imperium dat hij van binnenuit haat. Maar in deze laatste beslissende strijd zal hij niet alleen het hoofd moeten bieden aan zijn tirannieke vader, maar ook aan zijn moeder, waarvan men dacht dat ze dood was, en Nunnally, die zich heeft afgekeerd van Lelouch...
Sha Wu Sheng, de huurmoordenaar die bekend staat als de Screaming Phoenix Killer, koesterde een dodelijke vijandschap tegen de Enigmatic Gale, een meesterdief. Maar deze twee mannen waren het niet altijd oneens - in feite was Wu Sheng ooit in dienst van Enigmatic Gale, en hij zag zijn werkgever zelfs als een potentiële redder. Er was een ongelukkig toernooi voor nodig om de band tussen hen te vernietigen, waarvan de omstandigheden eindelijk zullen worden onthuld in deze Thunderbolt Fantasy-special! Daarna gaat het verhaal over Shang Bu Huan en onthult waar zijn pad hem bracht als gevolg van zijn reis naar Demon Spine Mountain.
Er zijn twee jaar verstreken sinds Bem, Bela en Belo verdwenen. Bem leeft nu het leven van zijn dromen met een vrouw en kinderen. Alleen heeft hij een nieuwe naam en geen herinnering aan zijn mensachtige monsterverleden. Is dit echt huiselijk geluk of iets sinisters?
In het jaar 2044 na Christus heeft de mensheid haar verkenning van de ruimte opgevoerd en de sterren bereikt door het wonder van ROBOTECHNOLOGIE, maar niet zonder een intergalactische oorlog over de aarde zelf te brengen. Helden zullen sterven en loyaliteiten zullen verschuiven. Maar te midden van de strijd zal er misschien vrede ontstaan door de verkoolde overblijfselen van de gehavende geschiedenis. Een van de grootste sciencefiction-saga's aller tijden gaat verder...