Mushi zijn wezens die niet kunnen worden omschreven als dieren, planten, insecten of geesten. Ze bestaan in veel verschillende soorten over de hele wereld. Ze leven in steden, in de natuur, in het water of in de lucht, maar ook naast planten, dieren en mensen. Sommige soorten komen per ongeluk, sommige zelfs opzettelijk, in contact met mensen en vormen een band die zowel goed als slecht voor hen kan zijn. De hoofdpersoon Ginko, een Mushishi, is een man die gespecialiseerd is in Mushi. Hij verzamelt informatie en redt tijdens zijn uitstapjes door het land vaak de levens van mensen die door Mushi zijn getroffen, of bevrijdt hen op zijn minst uit een onaangename situatie veroorzaakt door Mushi.
Gabimaru regeert als de sterkste en meest meedogenloze moordenaar in zijn dorp. Maar nu bevindt hij zich in de dodencel – met maar één uitweg: het levenselixer terughalen van een sinister eiland. Verlangend naar vrijheid aanvaardt hij de uitdaging. Maar hoe zal Gabimaru deze aangrijpende zoektocht overleven, nu zijn medegevangenen strijden om dezelfde prijs en demonische beesten op de loer liggen?
De vijftienjarige Chise heeft niets en niemand om voor te leven. Maar dat verandert wanneer ze de leerling en toekomstige echtgenote wordt van de onmenselijke magiër Elias.
Tijdens een concert van het populaire zangduo 'Zwei Wing' vallen monsters genaamd 'Noise' plotseling aan en beginnen het publiek te doden. Het meisje Hibiki ziet haar zekere dood al aankomen als Tsubasa en Kanade, de zangers van Zwei Wing, plotseling transformeren en tegen de monsters beginnen te vechten. Voor Hibiki zou deze dag een noodlottig keerpunt worden dat haar leven en toekomst voor altijd zou beïnvloeden.
Clevatess, een van de Lords of Dark Beasts, stort in wanneer hij een held die hij persoonlijk heeft gedood weer tot leven wekt en een verweesde humanoïde baby adopteert – de laatste hoop om een stervende wereld te redden. Welk lot staat dit onwaarschijnlijke trio te wachten nu ze samen zijn?
In Victoriaans Londen dwarsboomt de 12-jarige zakenmagnaat Ciel Phantomhive de gevaren voor de koningin terwijl hij wordt bewaakt door zijn demonen butler Sebastian.
Nadat een familietragedie haar leven op zijn kop zet, neemt de 16-jarige middelbare scholier Tohru Honda het heft in eigen handen en verhuist… naar een tent! Helaas voor haar zet ze haar nieuwe huis op privéterrein van de mysterieuze Soma-clan, en het duurt niet lang voordat de eigenaren haar geheim ontdekken. Maar Tohru komt er snel achter wanneer de familie aanbiedt haar in huis te nemen, de Soma's hebben hun eigen geheim: wanneer ze worden omhelsd door het andere geslacht, veranderen ze in de dieren van de Chinese dierenriem!
Nene Yashiro, eerstejaars middelbare scholier en occultist, roept 'Hanako-san van het toilet' op om haar romantische wensen te vervullen. Ze wordt Hanako's spirituele assistent en helpt hem bovennatuurlijke wezens te vernietigen en geruchten te veranderen om de geesten- en mensenwereld in evenwicht te brengen. Onderweg leert Nene over haar connectie met de geestenwereld en de duistere geheimen over Hanako's verleden.
Aoi is een universiteitsmeisje dat de kracht om geesten te zien heeft geërfd van haar grootvader, hoewel ze denkt dat haar grootste talent haar kookkunsten zijn. Op een dag, terwijl zij enkele geesten voedt, wil een boeman haar ontvoeren om met haar te trouwen met het excuus dat zij de schulden van haar grootvader moet betalen. Aoi zal echter weigeren en zal proberen deze schulden af te betalen door te gaan werken in Tenshinya, een herberg gerund door deze boeman.
In een wereld die heel erg op de onze lijkt, hebben grote renpaarden uit het verleden de kans om herboren te worden als 'paardenmeisjes': meisjes met de oren en staarten van paarden, maar ook met hun snelheid en uithoudingsvermogen. De beste van deze paardenmeisjes gaan trainen aan de Tracen Academy in Tokio, waar ze hopelijk roem en fortuin zullen verwerven als racers en idolen.
Special Week, een paardenmeisje van het platteland op de middelbare school, is net overgeplaatst naar Tracen en ze is vastbesloten haar belofte aan haar moeder na te komen om het beste paardenmeisje van Japan te worden. Op weg naar school maakt ze een pitstop op het circuit en wordt ze meteen verliefd op de stijl van Silence Suzuka, waarbij ze vastbesloten is om in hetzelfde team als zij te racen.
In het verhaal heeft Kagami Taiga zich net ingeschreven voor de Seirin High School als hij Kuroko Tetsuya van het basketbalteam van de school ontmoet. Kuroko is toevallig het schimmige zesde lid van het legendarische basketbalteam Generation of Miracles. Samen willen Kagami en Kuroko hun team naar het inter-high school kampioenschap brengen, tegen Kuroko's voormalige teamgenoten.
De rijke erfgename Catarina Claes wordt met een steen in het hoofd geslagen en haalt de herinneringen aan haar vorige leven terug. Het blijkt dat de wereld waarin ze leeft de wereld is van het spel Fortune Lover, een ander spel waar ze in haar vorige leven door geobsedeerd was... maar ze is gecast als de slechterik die de romances van de hoofdpersoon probeert te dwarsbomen!
Na een traumatische ervaring tijdens een regionale blazersbandcompetitie op de middelbare school, zweert eufoniumspeelster Kumiko Oumae de muziek af. Ze hoopt op een frisse start op de middelbare school. Maar het lot beschikt anders, want ze wordt omringd door mensen met een passie voor de schoolharmonie. Met de hulp van haar bandleden, zowel nieuwelingen als ervaren muzikanten, vindt Kumiko de motivatie om weer muziek te maken. Echter, binnen de band heerst pure chaos. Ondanks hun ambitie om zich te kwalificeren voor het nationale blazersbandkampioenschap, is zelfs deelname aan het lokale festival op dit moment een hele uitdaging. Tenzij de nieuwe bandleider, Noboru Taki, ingrijpt...
Yuichi heeft zijn neef Nayuki al jaren niet meer gezien. Nu hij terug is, is alle kennis van zijn bezoeken verdwenen. Hij probeert zich aan te passen aan de vaag vertrouwde omgeving, maar de gaten in zijn geheugen achtervolgen hem naarmate de tijd dringt. De stukjes van de puzzel zijn verschenen – een griezelig stille schoonheid met vlammende lokken, het mysterieuze meisje met de gevleugelde rugzak en de zwaard zwaaiende demonen doder – maar het is aan Yuichi om te ontdekken hoe ze in elkaar passen.
Over Eikichi Onizuka, een 22-jarig ex-gangsterlid en maagd. Hij heeft één ambitie die niemand ooit van hem verwachtte. Zijn enige levensdoel is om de beste leraar ooit op een middelbare school te worden.
Naoto Watari heeft al veel meegemaakt: hij verloor zijn ouders twee jaar geleden en sindsdien woont hij bij zijn tante met zijn zus. Omdat hij er alles aan doet om zijn zus te beschermen, wordt hij nu op school beschouwd als "degene met het zustercomplex" – maar het kan hem niet schelen, want voor hem komt zijn zus altijd op de eerste plaats. Maar wanneer Satsuki, een jeugdvriend en tegelijkertijd zijn verklaarde aartsvijand (?), plotseling naar zijn school verhuist, barst Naoto's tot nu toe rustige dagelijkse leven uit zijn voegen ... en Satsuki is misschien nog maar het begin.
In de regio Kanto strijden leerlingen om van hun school de heerser van deze regio te maken. Sonsaku Hakufu, die net is overgestapt naar de Nanyou High School, kan niets anders doen dan een aantal middelbare scholieren in elkaar slaan. Hakufu, die de reïncarnatie is van een beroemde krijger uit de oudheid en die geen idee heeft van de betekenis van een Magatama, wordt echter al snel een bedreiging en de clan van de 4 keizers besluit hem te elimineren. Ondertussen is er net een groot toernooi begonnen om te bepalen welke school soeverein van Kanto zal worden...
Een soort parasitaire buitenaardse wezens daalt neer op aarde en infiltreert snel de mensheid door de hersenen van kwetsbare doelen binnen te dringen; onverzadigbare wezens die de volledige controle over hun gastheer verwerven en in staat zijn zichzelf te transformeren om zich te voeden met nietsvermoedende prooien. Middelbare scholier Shinichi Izumi wordt het slachtoffer van een van deze parasieten, maar het wezen slaagt er niet in zijn hersenen over te nemen en belandt in zijn rechterhand.