Over Eikichi Onizuka, een 22-jarig ex-gangsterlid en maagd. Hij heeft één ambitie die niemand ooit van hem verwachtte. Zijn enige levensdoel is om de beste leraar ooit op een middelbare school te worden.
Het verhaal draait om Haruka Nanase, een jongen die er altijd van heeft gehouden om ondergedompeld te worden in water en erin te zwemmen. Voordat hij afstudeerde van de lagere school, nam hij deel aan een zwemtoernooi samen met zijn zwemclubleden, Makoto Tachibana, Nagisa Hazuki en Rin Matsuoka. Na het behalen van de overwinning ging elk van de jongens zijn eigen weg. De tijd verstreek en midden in hun rustige middelbare schoolleven verschijnt Rin en daagt Haruka uit voor een wedstrijd, waarbij hij Haruka zijn overweldigende kracht laat zien. Haruka wil niet dat het zo eindigt, en verzamelt Makoto en Nagisa opnieuw en brengt een nieuw lid genaamd Rei Ryugazaki mee om de Iwatobi High School Swimming Club op te richten om Rin te verslaan.
In het verhaal heeft Kagami Taiga zich net ingeschreven voor de Seirin High School als hij Kuroko Tetsuya van het basketbalteam van de school ontmoet. Kuroko is toevallig het schimmige zesde lid van het legendarische basketbalteam Generation of Miracles. Samen willen Kagami en Kuroko hun team naar het inter-high school kampioenschap brengen, tegen Kuroko's voormalige teamgenoten.
Een geheim leven is het enige dat ze gemeen hebben. Op school is Hori een keurige en perfecte sociale vlinder, maar de waarheid is dat ze een onbezonnen huisvrouw is. Ondertussen verbergt Miyamura onder een sombere façade een zachtaardig hart, samen met piercings en tatoeages. Tijdens een toevallige ontmoeting onthullen ze allebei een kant die ze nog nooit hebben laten zien. Zou dit kunnen uitgroeien tot iets nieuws?
Fuutarou Uesugi is een arme, asociale topstudent die op een dag de rijke transferstudent Itsuki Nakano ontmoet. Ze maken ruzie, maar wanneer Uesugi beseft dat hij haar mentor moet worden, probeert hij betere voorwaarden te krijgen. Terwijl hij dat probeert, ontmoet hij vier andere meisjes.
In een wereld die heel erg op de onze lijkt, hebben grote renpaarden uit het verleden de kans om herboren te worden als 'paardenmeisjes': meisjes met de oren en staarten van paarden, maar ook met hun snelheid en uithoudingsvermogen. De beste van deze paardenmeisjes gaan trainen aan de Tracen Academy in Tokio, waar ze hopelijk roem en fortuin zullen verwerven als racers en idolen.
Special Week, een paardenmeisje van het platteland op de middelbare school, is net overgeplaatst naar Tracen en ze is vastbesloten haar belofte aan haar moeder na te komen om het beste paardenmeisje van Japan te worden. Op weg naar school maakt ze een pitstop op het circuit en wordt ze meteen verliefd op de stijl van Silence Suzuka, waarbij ze vastbesloten is om in hetzelfde team als zij te racen.
Toen ze jong waren, beloofden de broers Mutta en Hibito elkaar dat ze astronaut zouden worden. Nu, in 2025, heeft Hibito zijn droom gevolgd om de eerste Japanner op de maan te worden, maar Mutta is net ontslagen van zijn baan. Zijn broer herinnert hem aan hun kinderbelofte en Mutta besluit opnieuw naar de ruimte te streven.
Zijn vorige leven en huidige leven kruisen elkaar: een jongen met herinneringen aan twee levens staat voor zijn lot! Nadat zijn moeder op jonge leeftijd werd vermoord, vocht de wees Rio het hardst om te overleven in de sloppenwijken. Op een dag wordt hij wakker met de herinneringen aan Haruto Amakwa, die omkwam bij een ongeluk terwijl hij ervan droomde herenigd te worden met zijn jeugdvriend, en Rio beseft dat hij is gereïncarneerd in een wereld van zwaarden en tovenarij.
Hairi Takahara had nooit verwacht dat de zomer als een droom zou aanvoelen. Gestuurd naar Torishirojima om de bezittingen van zijn overleden grootmoeder te doorzoeken, heeft hij eindeloze zee, rustige nostalgie en mysterieuze meisjes ontmoet, elk net iets buiten bereik. Terwijl hij zich vestigt in het eilandleven, beginnen verloren herinneringen naar boven te komen en vindt hij wat hij nooit wist dat hij had verloren.
Aoi is een universiteitsmeisje dat de kracht om geesten te zien heeft geërfd van haar grootvader, hoewel ze denkt dat haar grootste talent haar kookkunsten zijn. Op een dag, terwijl zij enkele geesten voedt, wil een boeman haar ontvoeren om met haar te trouwen met het excuus dat zij de schulden van haar grootvader moet betalen. Aoi zal echter weigeren en zal proberen deze schulden af te betalen door te gaan werken in Tenshinya, een herberg gerund door deze boeman.
Yukihira Souma's droom is om fulltime chef-kok te worden in het restaurant van zijn vader en de culinaire vaardigheden van zijn vader te overtreffen. Maar net als Yukihira afstudeert aan de middelbare school, sluit zijn vader, Yukihira Jouichirou, het restaurant om de wereld rond te reizen en te koken. Hoewel onderdrukt, wordt Souma's vechtlust weer aangewakkerd door een uitdaging van Jouichirou, namelijk overleven op een elite culinaire school waar slechts 10% van de studenten afstudeert.