Welkom in Maebashi City, in de prefectuur Gunma. Voor eerstejaars middelbare scholier Yuina Akagi neemt haar middelmatige leven een wilde wending op het moment dat een mysterieuze kikker genaamd Keroppe opduikt en haar vraagt: 'Waarom word je geen heks?' Samen met Azu Niisato, Kyoka Kitahara, Choco Mitsumata en Mai Kamiizumi zijn Yuina en haar vrienden enthousiast om de dromen van mensen waar te maken als de Maebashi-heksen.
Sinds de dood van zijn vader kan mangakunstenaar Ichiro ternauwernood rondkomen en is hij gedwongen zijn twee jongere broers en zussen te onderhouden met slechts een middelbare schoolopleiding. Hij heeft niet eens de tijd om een computer te leren gebruiken, wat hem dwingt te blijven worstelen met pen en papier. Wanneer zijn kunstassistenten stoppen om voor zichzelf te beginnen, naast het jongleren met deadlines, familie en de voortdurende angst om zijn baan te verliezen, voelt Ichiro zich dicht bij een totale instorting. Maar dan verschijnt er een nieuwe assistent in Ichiro's leven, en zijn vooruitzichten beginnen meteen beter te worden! Ze is een ongelooflijke kunstenares, ze is altijd op tijd klaar en ze is bovendien prachtig! Maar ze lijkt ook heel veel over hem te weten, en al snel doet ze een bekentenis die Ichiro's geest voorbij de grenzen van de aarde doet buigen...
Er hebben ooit berg hoge beesten bestaan waarvan de overblijfselen mana uitstraalden en mensen aantrokken. Verscheidene jaren gingen voorbij en er brak een oorlog uit tussen de Jerle Federatie, die deze oer beesten aanbidt, en het Gildllan-rijk, waaraan nog geen einde is gekomen. Leo, een jonge ridder kadet van de Federatie, wordt samen met zijn jeugdvriendin Celia en zijn instructeur Lisette op een missie gestuurd naar de voormalige keizerlijke grensstad Lunne. Daar ontmoeten ze Hugo, een oude vriend die zijn land heeft verraden en zich bij het rijk wil aansluiten...
Nadat het leger van het Magic Mineral Empire hun thuisland, het Bloemenrijk, heeft aangevallen, moeten de feeën Himawari en Tsubaki vluchten naar de stad Romangai. Hier leven ze een paar jaar in vrede, maar op een dag wordt Himawari's vriend Ajisai ontvoerd. Himawari en Tsubaki gaan samen op pad om hun vriend te redden, maar de gevreesde soldaten van het Magic Mineral Empire staan hen in de weg!
Kazuto is een normale jongen: hij ziet er normaal uit, hij runt samen met zijn zusje een badhuis en hij bezit een stukje ziel van een buitenaardse prinses. Hoe is dit zo gekomen?
Valkyrie, prinses van een verre planeet, stort met haar ruimte zweefvliegtuig neer in Kazuto's badhuis. De botsing verwondt hem dodelijk, en Valkyrie besluit zijn leven te redden door hem een stukje van haar ziel te geven. Er zijn maar twee voorwaarden: ze moet bij hem blijven, anders zullen zowel zij als Kazuto sterven. Omdat haar ziel verzwakt is, transformeert ze mentaal en fysiek terug in een basisschoolleerling.
De Aquarion, een gigantisch gemechaniseerd vecht pak, is het beste wapen van de mensheid tegen interstellaire bedreigingen. Menselijke piloten trainden en werkten samen om Shadow Angels, binnenvallende ontvoerders en kinetische energiemonsters gedurende duizenden jaren te verslaan. Nogmaals, de mensheid moet zich wenden tot de Aquarion. Zal het pak, nu het lot van de aarde op het spel staat, genoeg zijn om de mensheid te redden?
Drie jaar zijn verstreken sinds de strijd met het White Comet Empire. President Dessler, die op zoek is naar een nieuwe moederster om het stervende Gamilas-volk te redden, vindt in een deel van het Melkwegstelsel een ster die aan de voorwaarden voldoet. Maar het bevond zich op het grondgebied van een machtige interstellaire natie. Bij het territoriale geschil dat in de Melkweg uitbrak, is onvermijdelijk de aarde betrokken, die een veiligheidsverdrag heeft met Gamilas. De magie van de tijdfout, die de aarde militaire en economische voordelen opleverde, is verdwenen in ruil voor hun eigen leven. Susumu Kodai vertrekt met de nieuwe bemanning op een trainingsreis ter voorbereiding op een naderende noodsituatie. Zonder te weten dat iemand die op zichzelf mikt, er middenin zit. Yamato staat op het punt een nieuwe reis te ondernemen in een tijdperk van ongekende angst. Onderweg wacht een onvoorstelbare nieuwe vijand...