Nicolas Shaw is een gepensioneerd speciaal agent, die deel gaat uitmaken van een "onzichtbaar" eliteteam dat stilletjes de ergste schurken uitschakelt. Nadat hij de schuld heeft gekregen van de moord op teamgenoten, moet Shaw zijn naam zuiveren en voorkomen dat een nieuwe generatie nobele agenten wordt vermoord.
Kenshin Himura is een legendarische zwaardvechter. Hij is gestopt met het doden door middel van het zwaard. Hij probeert een vredig leven te leiden met Kaoru Kamiya die in het dorp een zwaardvechtersschool runt. Maar de zaken veranderen als het Akabeko restaurant, waar Kenshin Himura het liefst gaat eten, wordt verwoest. Kenshin Himura vindt daar een briefje waarop geschreven staat "Junchu".
Strijdersaap Trask is neergestort op een dode wereld, gestrand en klaar om zich eervol bij zijn oudsten te voegen in het hiernamaals. Maar dat wordt onderbroken wanneer een menselijk terraforming-schip arriveert om de planeet te herstellen. Al snel bevindt deze eenzame overlevende van een aap zich in het middelpunt van een intergalactisch conflict tussen een hebzuchtig bedrijf, een fanatieke religieuze sekte en een ras van vijandige buitenaardse wezens die op zoek zijn naar apen als voedsel. Zijn enige kans op vrijheid is met de hulp van een sympathieke en vindingrijke legerkolonel. Maar kunnen zij alleen een totale oorlog in de kosmos voorkomen?