Student Yuki heeft nog nooit een van de gigantische monsters gezien waar ze altijd over hoort op het nieuws en die haar stad bedreigen. Maar als ze op een dag de lethargische Tetsu ontmoet, veranderen de dingen plotseling. Omdat Tetsu door de huizen beweegt met een wezen genaamd Cencoroll, dat hij kan besturen met mind control en dat kan transformeren in een grote verscheidenheid aan objecten. Maar niet alleen Yuki is gefascineerd door Cencoroll: de jongen Shu probeert met behulp van zijn eigen telepathie monster Cencoroll van Tetsu af te pakken, waarop de vier een bittere strijd aangaan, waarbij ook Yuki tussenbeide komt en de hele stad wordt omgetoverd tot een strijdarena.
Kafka's Supermarket is een experimentele, surrealistische sciencefiction-dystopische horrorfilm die de problemen van het huidige kapitalistische Amerika behandelt, waarbij de nadruk ligt op de vervreemding en ontmenselijking van het commercialisme. Marktobsessies worden teruggebracht tot hun meest oorspronkelijke toestanden, waardoor een hedendaagse utopie wordt overspoeld met een nihilistische fixatie op dood en seksualiteit, waardoor de hele stad een conceptueel kannibalistische vleesmarkt wordt. Marktonderzoekers en psychoanalytici kijken onverschillig toe hoe de mentale toestanden van hun proefpersonen snel in een depressieve verdoving verzinken.
Onze vriendelijke buurtsuperheld besluit om samen met zijn beste vrienden Ned, MJ en anderen op vakantie naar Europa te gaan. Het plan van Peter om een paar weken geen superheld te zijn, moet hij echter snel schrappen wanneer hij met tegenzin instemt om Nick Fury te helpen het mysterie van verschillende elementaire aanvallen van wezens te ontrafelen. Spider-Man en Mysterio bundelen hun krachten om de chaos op het continent te bestrijden, maar niets is wat het lijkt.